232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06610 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  96.85 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  65.49 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  55.07 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  54.85 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  53.99 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  59.11 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  58.05 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  58.13 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  58.13 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  48.48 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  48.05 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  43.61 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  42.79 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  42.48 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  41.74 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  42.34 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  42.22 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  41.82 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  42.08 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  41.89 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  41.89 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  40.09 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  40.91 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  40.54 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  40.54 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  43.5 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  40.54 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  41.89 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  40.45 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  41.26 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  38.53 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  38.53 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  38.53 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  42.79 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  40.38 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  39.29 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  36.45 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  36.7 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  36.24 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  38.54 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  40.87 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  37.16 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  38.22 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  35.27 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  35.27 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  35.27 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  35.27 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  35.27 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  35.27 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  36.59 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  35.27 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  37.13 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  35.27 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  35.27 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  37.72 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  37.72 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  37.72 
 
 		 212 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  37.72 
 
 		 212 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  37.72 
 
 		 212 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  35.56 
 
 		 202 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  37 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  36.45 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  35.53 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  39.44 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  36.07 
 
 		 209 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  36.95 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  37.13 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  36.78 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  33.33 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  34.15 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  36.32 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  36.32 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  33.18 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  33.17 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  34.65 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  31.86 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  32.95 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  30.19 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  29.61 
 
 		 216 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  29.25 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  30.26 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  29.25 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  29.25 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  29.25 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  29.25 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  26.86 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  30.57 
 
 		 245 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  30.63 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  31.49 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  27.83 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  29.07 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  30.18 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  29.7 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  29.7 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  32.79 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  31.31 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  35.29 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  30.99 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  28.72 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>