215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0976 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  100 
 
 		 210 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  56.99 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  43.93 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  43.46 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  43.46 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  43.46 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  43.46 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  44.08 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  44.7 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  43.64 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  44.33 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  44.33 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  44.13 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  46.01 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  46.39 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  46.39 
 
 		 221 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  46.39 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  46.39 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  46.39 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  45.88 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  41.43 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  46.91 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  46.24 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  44.67 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  43.66 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  41.71 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  39.74 
 
 		 228 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  41.24 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  39.62 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  40.53 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  43.55 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  44.09 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  42.73 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  44.09 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  42.49 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  43.4 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  41.78 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  41.4 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  38.1 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  44.57 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  40.64 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  43.23 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  40.53 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  42.03 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  42.03 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  40.98 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  39.3 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  41.44 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  36.99 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  43.48 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  37.44 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  42.93 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  43.46 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  35.22 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  33.68 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  35.16 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  39.44 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  38.1 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  37.96 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  39.15 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  37.98 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  39.81 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  35.27 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  39.05 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  39.05 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  34.55 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  41.21 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  38.92 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  37.14 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  38.2 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  37.62 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  37.62 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  37.62 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  37.14 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  35.24 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  39.89 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  37.96 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  38.24 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  36.06 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  36.06 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  38.24 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  38.12 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  36.63 
 
 		 227 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  37.56 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  35.58 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  36.63 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  36.27 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  36.62 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  38.22 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  38.22 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  32.88 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  38.22 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  38.22 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  38.22 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  38.22 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  37.04 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  33.19 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  37.04 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  37.44 
 
 		 214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  37.04 
 
 		 212 aa  118  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>