232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1086 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  53.24 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  49.73 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  46.04 
 
 		 202 aa  177  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  50.28 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  50.28 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  43.17 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  47.7 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  41.1 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  40.27 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  40 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  38.39 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  40.97 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  42.4 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  39.35 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  39.35 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  39.35 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  41.45 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  39.91 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  42.72 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  39.11 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  41.35 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  39.81 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  37.77 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  41.71 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  39.81 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  45.36 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  38.57 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  41.04 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  43.4 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  40 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  42.19 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  39.53 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  39.52 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  42.13 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  39.46 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  39.46 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  39.66 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  42.41 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  39.46 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  42.36 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  40.54 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  39.46 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  39.46 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  42.36 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  38 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  39.46 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  37.8 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  37.8 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  41.36 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  38.12 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  38.03 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  38.12 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  36.82 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  38.12 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  37.79 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  36.79 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  37.13 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  39.52 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  38.25 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  39.52 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  36.97 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  36.41 
 
 		 219 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  37.25 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  37.14 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  37.22 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  37.22 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  37.22 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  37.22 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  39.52 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  34.45 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  37.22 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  37.33 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  38.79 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  35.41 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  38.03 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  38.18 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  39.34 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  37.57 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  35.92 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  37.04 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  37.04 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  39.22 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  37.09 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  39.11 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  34.54 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  36.54 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  32.31 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  35.29 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  32.87 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  36.5 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  35.22 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  37.84 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  32.53 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  35.75 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  37.75 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  38.61 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  37.5 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  37.31 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  36.57 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>