200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2012 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  85.07 
 
 		 203 aa  318  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  85.07 
 
 		 201 aa  318  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  51.55 
 
 		 202 aa  207  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  53.01 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  53 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  55.43 
 
 		 209 aa  201  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  46.6 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  46.6 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  46.24 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  41.09 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  41.49 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  43.68 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  39.23 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  39.9 
 
 		 213 aa  131  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  39.22 
 
 		 210 aa  130  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  37.75 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  38.35 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  36.16 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  37.44 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  38.83 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  37.14 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  34.48 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  38.32 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  35.08 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  35.08 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  36.6 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  37.32 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  35.64 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  34.48 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  35.58 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  36.5 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  37.36 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  37.36 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  37.36 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  36.97 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  33.82 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  35.98 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  35.98 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  35.05 
 
 		 212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  35.05 
 
 		 212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  36.02 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  35.05 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  35.05 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  37.76 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  35.98 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  35.05 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  37.25 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  35.05 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  35.05 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  35.05 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  35.05 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  31.28 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  36.02 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  36.02 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  35.02 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  36.27 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  37.76 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  35.75 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  31.8 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  38.51 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  34.91 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  35.68 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  35.68 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  34.21 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  31.6 
 
 		 215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  38.22 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  35.44 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  33.68 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  32.22 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  36.08 
 
 		 215 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  34.72 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  33.66 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  33.66 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  33.66 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  33.66 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  33.66 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  33.66 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  31.67 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  34.95 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  34.16 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  34.95 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  33.51 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  34.95 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  34.95 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  34.95 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  34.27 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  33.51 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  34.66 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  35.15 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  33.75 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  33.86 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  35.62 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  33.51 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  30.73 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  33.51 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  33.51 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  33.51 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  32.98 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>