194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3220 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  56.52 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  58.01 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  58.01 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  51 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  52.88 
 
 		 209 aa  206  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  48.69 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  55.25 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  50.54 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  50.53 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  45.16 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  46.03 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  40.5 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  38.57 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  38.1 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  38.1 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  37.89 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  40.09 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  42.06 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  38.25 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  37.5 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  42.06 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  39.72 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  37.79 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  37.33 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  36.15 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  38.18 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  36.36 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  35.87 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  40.85 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  37.85 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  40.85 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  36.07 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  35.48 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  36.36 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  35.48 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  39.91 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  35.14 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  40 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  36.36 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  36.36 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  36.24 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  35.74 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  38.36 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  35.74 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  36.49 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  38.21 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  32.16 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  37.44 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  35.05 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  34.29 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  37.5 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  34.29 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  32.52 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  33.81 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  33.81 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  34.31 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  33.95 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  32.64 
 
 		 237 aa  114  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  34.63 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  33.65 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  32.69 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  32.86 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  32.86 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  34.12 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  34.48 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  33.8 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  35.96 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  34.48 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  30.81 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  33.33 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  33.69 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  33.78 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  30.8 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  32.6 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  33.5 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  33.5 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  33.67 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  33.85 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  33.5 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  32.13 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  33.5 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  33.5 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  33.5 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  33.67 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  32.39 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  34.88 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  33 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  31.37 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  32.23 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  32.99 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>