200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3290 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  67.03 
 
 		 219 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  61.27 
 
 		 204 aa  229  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  59.3 
 
 		 195 aa  218  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  59.3 
 
 		 195 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  57 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  57.29 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  57.87 
 
 		 198 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  54.5 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  50.24 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  50.24 
 
 		 224 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  45.81 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  45.71 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  44.29 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  44.76 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  42.79 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  46.48 
 
 		 228 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  48.37 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  40.18 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  39.15 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  38.38 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  40.49 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  40.84 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  40.45 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  38.42 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  39.33 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  39.89 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  39.89 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  39.89 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  39.89 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  39.89 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  38.2 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  36.45 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  36.45 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  36.45 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  36.45 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  36.45 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  36.45 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  37.64 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  37.64 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  41.85 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  43.48 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  35.15 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  41.85 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  35.91 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  38.93 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  38.61 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  39.22 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  38.71 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  39.9 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  41.18 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  34.44 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  38.17 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  39.04 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  34.42 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  37.57 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  39.25 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  38.71 
 
 		 227 aa  104  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  38.71 
 
 		 227 aa  104  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  32.6 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  34.67 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  36.27 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  33.78 
 
 		 224 aa  98.2  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  37.44 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  33.97 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  36.76 
 
 		 229 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  35.05 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  34.98 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  35.44 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  35.44 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  33.8 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  33.96 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  34.06 
 
 		 228 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  31.51 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  35.14 
 
 		 218 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  35.94 
 
 		 243 aa  91.3  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  31.61 
 
 		 267 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  35.55 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  34.12 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  34.12 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  34.7 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  34.95 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  33.65 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  35.81 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  31.09 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  35.81 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  34.76 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  30.54 
 
 		 224 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  30.32 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  33.17 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  34.29 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1244  OmpW  33.33 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000847221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  31.8 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  33.49 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  34.29 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  33.65 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  33.02 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  32.82 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>