231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1128 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  85.98 
 
 		 214 aa  350  7e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  47.66 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  45.7 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  46.41 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  44.34 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  42.13 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  42.36 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  45.79 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  44.98 
 
 		 195 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  40.26 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  44.98 
 
 		 195 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  43.98 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  44.67 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  46.56 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  46.56 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  42.27 
 
 		 267 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  41.36 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  42.25 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  43 
 
 		 216 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  42.03 
 
 		 227 aa  147  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  45.79 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  42.44 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  41.95 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  42.93 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  43 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  42.22 
 
 		 198 aa  141  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  40.85 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  40 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  39.42 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  35.21 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  35.81 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  36.15 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  35.19 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  35.19 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  35.19 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  35.19 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  35.19 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  35.48 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  41.44 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  37.73 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  37.04 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  35.43 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  35.5 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  35.5 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  33.94 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  37.33 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  33.78 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  39.56 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  39.01 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  39.01 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  39.01 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  39.01 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  39.01 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  34.2 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  34.85 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  31.74 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  30.41 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  33.02 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  33.02 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  32.56 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  35.35 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  33.8 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  33.33 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  34.55 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  30.28 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  34.13 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  30.49 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  30.09 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  31.67 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  29.72 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  30.09 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  30.73 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  30.09 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  30.09 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  30.09 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  30.09 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  31.86 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  30.09 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  33.03 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  31.58 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  32.26 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  33.48 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  29.01 
 
 		 209 aa  84.7  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  31.33 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  31.33 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  31.37 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  30.37 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  29.17 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  28.72 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  29.17 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  29.77 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  29.95 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  32.56 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  35.16 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  35.37 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  30.12 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  31.54 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  30.41 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>