227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0580 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  70.14 
 
 		 233 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  53.16 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  51.93 
 
 		 230 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  55.56 
 
 		 229 aa  227  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  54.88 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  51.56 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  54.59 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  47.53 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  48.95 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  46.09 
 
 		 267 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  46.91 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  46.24 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  43.92 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  41.8 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  41.99 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  44 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  44 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  42.33 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  41.04 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  37.05 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  39.37 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  43.85 
 
 		 206 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  41.05 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  42.34 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  40.96 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  36.8 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  38.04 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  43.43 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  34.9 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  38.66 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  37.73 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  36.76 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  37.7 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  37.91 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  37.91 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  37.91 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  37.91 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  37.91 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  37.91 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  37.91 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  38.38 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  35.4 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  37.84 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  37.84 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  37.84 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  37.84 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  38.95 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  37.33 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  38.39 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  36.41 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  39.47 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  38.5 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  38.92 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  37.72 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  40.83 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  33.64 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  41.85 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  38.5 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  29.96 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  42.24 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  39.62 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  34.07 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  32.98 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  37.42 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  33.49 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  31.07 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  34.87 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  33.49 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  36.65 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  36.65 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  36.54 
 
 		 200 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  33.5 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  34.59 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  34.16 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  36.48 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  34.81 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  36.59 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  30.93 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  30.74 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  34.73 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  34.73 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  34.73 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  32.4 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  31.33 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  35.47 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1545  OmpW family protein  35.19 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281829  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  30.71 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  34.78 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  32.79 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  30 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  32.05 
 
 		 215 aa  85.5  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  33.86 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  34.52 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  35.54 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  34.52 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>