230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5444 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  47.87 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  47.87 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  36.63 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  35.08 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  31.91 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  39.47 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  34.8 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  33.33 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  38.1 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  32.46 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  29.77 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  35.98 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  35.98 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  34.34 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  33.83 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  35.54 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  33.54 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1185  OmpW family outer membrane porin  34.57 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  34.76 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  33.16 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  34.34 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  35.8 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  33.5 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  33.74 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  32.52 
 
 		 215 aa  92.4  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  34.27 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  34.36 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  34.57 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  30.21 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  30.25 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  28.75 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  37.04 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  30.3 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  31.32 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  31.74 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  35.19 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  33.13 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  33.13 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  35.19 
 
 		 195 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  25.83 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  35.19 
 
 		 195 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  31.28 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  30.22 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  32.52 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  25.74 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  29.17 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  29.17 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  29.17 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  33.13 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  33.13 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  30.54 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  31.1 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  32.52 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  31.61 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  34.78 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  27.68 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  31.3 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  29.74 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  34.03 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  29.94 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  29.96 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  30.18 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  35.19 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  30.49 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  27.39 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  30.59 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  28.91 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  34.83 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  28.44 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  31.9 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  31.46 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  31.9 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  29.88 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  34.36 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  28.92 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  32.46 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  26.05 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  28.11 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  28.11 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  36.47 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  28.11 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  28.11 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  28.11 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  28.11 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  30.86 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  30 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  28.57 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  30.86 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  30.67 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  30.67 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  30.86 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  28.51 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  29.01 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  28.48 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  28.48 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  28.4 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>