231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3593 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  91.7 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  77.59 
 
 		 240 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  63.37 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  63.37 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  63.37 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  63.37 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  63.37 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  63.37 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  63.37 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  62.96 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  60.49 
 
 		 243 aa  294  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  60.49 
 
 		 243 aa  294  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  60.08 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  62.55 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  61.32 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  61.32 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  60.91 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  49.79 
 
 		 241 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  52.81 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  51.6 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  52.05 
 
 		 239 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  46.28 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  43.15 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  43.15 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  43.15 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  42.97 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  40.24 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  38.97 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  38.97 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  38.97 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  38.97 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  38.97 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  38.97 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  38.97 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  38.97 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  39.19 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  38.29 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  38.32 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  36.97 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  36.29 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  37.55 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  37.6 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  37.21 
 
 		 277 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  37.21 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  36.63 
 
 		 286 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  36.82 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  37.21 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  36.82 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  36.43 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  35.25 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  35.25 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  36.82 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  38.79 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  35.25 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  35.48 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  35.48 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  35.48 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  35.48 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  36.43 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  34.77 
 
 		 290 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  36.57 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  34.17 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  34.17 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  34.17 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  35.14 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  35.14 
 
 		 274 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  33.2 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  33.2 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  30.86 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  34.84 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  32.38 
 
 		 213 aa  99  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  33.18 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  27.08 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  31.15 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  27.08 
 
 		 211 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  27.08 
 
 		 211 aa  95.9  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  28.75 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  28.87 
 
 		 210 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  31.44 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  29.09 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  30 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  30 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  28.22 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  29.82 
 
 		 230 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  27.92 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  30.49 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  27.92 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  27.62 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  27.87 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.38 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.38 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  28.82 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  28.38 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  28.14 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  29.39 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  28.07 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  29 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  29 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>