211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0434 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  47.11 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  42.61 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  37.72 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  35.11 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  31.77 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  29.22 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  32.98 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  28.83 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  34.02 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  34.5 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  32.11 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  30.43 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  31.56 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  28.44 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  27.84 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  27.85 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  28.63 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  30.43 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  27.78 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  31.25 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  28.83 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  31.96 
 
 		 224 aa  88.6  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  28.04 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  28.51 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  27.16 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  29.7 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  29.05 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  29.85 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  28.12 
 
 		 200 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  26.11 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  35.8 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  29.81 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  27.83 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  29.08 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  31.73 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  31.73 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  28.82 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  29.27 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  29.27 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  26.52 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  28.42 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  27.1 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1185  OmpW family outer membrane porin  28.4 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  26.14 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  28.42 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  28.05 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  26.94 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  27 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  27 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  25.55 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  26.67 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  27 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  27.27 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  29.63 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  27 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  29.36 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  27 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  27 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  27 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  27.59 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  27 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  26.52 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  26.24 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  26.21 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  27.81 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  27.47 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  30.18 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  26.7 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  27.27 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  28.79 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  25.51 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  26.64 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  26.64 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  29.63 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  28.7 
 
 		 204 aa  72  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  29.86 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  26.18 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  22.81 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  25.65 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  25.65 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  26.29 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  26.09 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  22.57 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  30.36 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  22.57 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  22.57 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  29.09 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  25 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  25.65 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  25.87 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  24.5 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  25.66 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  24.67 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  26.18 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  26.83 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  24.02 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  26.84 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  26.24 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  23.72 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>