228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4877 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  100 
 
 		 251 aa  500  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  46.84 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  42.42 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  36.63 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  36.59 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  38.02 
 
 		 211 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  39.08 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  39.9 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  39.9 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  34.84 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  38.42 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  38.99 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  37.67 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  36.68 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  34.68 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  37.72 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  35.83 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1185  OmpW family outer membrane porin  40.14 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  34.8 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  36.74 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  33.68 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  36.6 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  35.35 
 
 		 214 aa  98.6  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  35.29 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  32.02 
 
 		 195 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  32.02 
 
 		 195 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  37.34 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  32.82 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  34.55 
 
 		 198 aa  88.6  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  29.95 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  29.25 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  27.91 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  30.53 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  31.31 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  31.34 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  32.45 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  33.54 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  30.87 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  29.38 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  31.33 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  26.56 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  30.11 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  27.18 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  33.14 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  27.18 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  27.18 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  33.16 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  33.16 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  33.16 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  33.16 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  33.16 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  33.16 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  33.16 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  32.72 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  26.04 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  25.37 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  31.19 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  35.29 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  29.03 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  31.03 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  27.54 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  33.73 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  32.26 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  30.93 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  29.5 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  25.42 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  30.91 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  26.67 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  35.45 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  32.09 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  34.52 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  27.75 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  30.12 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  30.9 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  30.9 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  30.9 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  30.9 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  30.9 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  30.9 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  30.9 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  30.9 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  29.06 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  29.25 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  26.45 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  28.64 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  26.99 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  25.73 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  25.73 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  32.08 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  30.19 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  26.49 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  31.94 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  31.94 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  26.14 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  31.94 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  26.49 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  29.49 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  29.95 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  29.35 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  29.95 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>