231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3286 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  70.53 
 
 		 230 aa  317  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  68.92 
 
 		 223 aa  310  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  45.02 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  34.23 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  33.62 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  34.22 
 
 		 210 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  35.07 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  31.67 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  30.9 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  32.02 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  32.61 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  33.78 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  33.78 
 
 		 215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  32.75 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  33.04 
 
 		 210 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  35.45 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  34.25 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  34.23 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  34.23 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  33.8 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  31.47 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  29.77 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  34.09 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  34.09 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  34.62 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  33.64 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  31.44 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  32.31 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  31.82 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  35.59 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  30.62 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  33.89 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  30.13 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  30.13 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  30.13 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  30.4 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  29.68 
 
 		 213 aa  98.2  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  31.25 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  32.58 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  32.58 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  32.58 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  32.58 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  32.58 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  32.58 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  32.58 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  30.36 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  29.29 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  29.29 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  30.36 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  29.83 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  29.29 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  28.57 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  30.83 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  29.2 
 
 		 202 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  29.41 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  29.55 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  30.81 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  27.23 
 
 		 202 aa  91.7  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  29.91 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  30.81 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  28.21 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  28.51 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  30.81 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  30.81 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  29.49 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  30.81 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  30.73 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  29.66 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  29.52 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  29.52 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  29.52 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  29.52 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  30.58 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  29.52 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  29.52 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  29.52 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  29.52 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  29.52 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  29.13 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  30.7 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  26.64 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  28.91 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  28.39 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  30.36 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  28.84 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  28.84 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  29.09 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  30.2 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  29.31 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  31.84 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5480  OmpW  28.19 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.479641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  25.9 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  27.43 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  27.36 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  32.72 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  26.98 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>