232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2790 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  77.59 
 
 		 241 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  74.27 
 
 		 241 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  62.56 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  62.56 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  62.56 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  62.56 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  62.56 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  62.56 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  62.56 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  61.11 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  56.79 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  56.79 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  59.64 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  59.01 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  59.01 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  60.09 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  56.38 
 
 		 243 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  47.92 
 
 		 241 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  51.08 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  49.32 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  48.86 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  44.4 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  41.77 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  41.77 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  41.77 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  41.22 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  41.37 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  44.26 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  41.01 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  41.01 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  41.01 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  41.01 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  41.01 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  41.01 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  41.01 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  41.01 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  36.69 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  37.92 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  34.89 
 
 		 274 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  39.38 
 
 		 277 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  34.89 
 
 		 274 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  39.38 
 
 		 277 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  38.76 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  39.38 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  36.8 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  38.76 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  38.76 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  38.37 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  36.33 
 
 		 274 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  36.33 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  36.33 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  36.33 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  36.33 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  35.97 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  37.39 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  35.97 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  38.87 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  34.17 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  36.6 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  33.81 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  33.81 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  33.81 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  36.76 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  34.98 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  34.11 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  34.11 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  33.06 
 
 		 308 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  33.06 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  30.54 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  27.2 
 
 		 382 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  31.98 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  33.18 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  30.22 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  30.74 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  29.58 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  30.47 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  26.91 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  30.26 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  28.03 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  28.03 
 
 		 211 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  28.03 
 
 		 211 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  30.2 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  29.41 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  29.05 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  29.61 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  27.23 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  28 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  30.77 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  27.92 
 
 		 202 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  27.8 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  26.61 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  26.61 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  28.45 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  25.74 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  28.27 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  27.5 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  26.75 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  29.31 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  26.75 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>