225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0436 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  49.74 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  47.87 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  34.68 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  30.48 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  29.5 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  27.36 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  28.32 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  28.57 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  29 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  34.66 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  33.87 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  29.31 
 
 		 255 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  31.68 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  29.71 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  32.77 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  30.51 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  28 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  31.53 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  31.64 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  31.44 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  27.67 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  25.73 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  27.18 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  29.94 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  27.18 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  27.18 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  28.48 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  29.81 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  29.81 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.5 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.5 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  29.88 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  29.01 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  30.12 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  26.37 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  30.67 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  29.19 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  29.27 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  28.57 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  30.41 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1185  OmpW family outer membrane porin  29.19 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  29.74 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  29.82 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  29.88 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  29.23 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  27.98 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  26.95 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  28.05 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  30.23 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  28.05 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  30.23 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  28.26 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  31.31 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  28.57 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  30.23 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  31.43 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  30.23 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  26.07 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  27.45 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  26.11 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  26 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  31.12 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  30.23 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  26 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  26.19 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  29.57 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  26.6 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  26.77 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  26.77 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  26.77 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  26.77 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  27.88 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  26.77 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  27.88 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  26.77 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  26.77 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  26.77 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  28.57 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  25.11 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  27.98 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  27.27 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  24.89 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  26.5 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  26.82 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  26.5 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  24.88 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  27.03 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  29.17 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  30.36 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  26.4 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  25.11 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  30.36 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>