217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2289 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  71.36 
 
 		 204 aa  291  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  66.34 
 
 		 219 aa  247  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  64.18 
 
 		 227 aa  246  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  63.5 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  60.67 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  61.85 
 
 		 196 aa  207  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  50.47 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  50.95 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  48.51 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  51.24 
 
 		 245 aa  187  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  49.27 
 
 		 224 aa  184  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  46.3 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  44.02 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  44.5 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  43.54 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  47.06 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  45.13 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  40.93 
 
 		 243 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  47.03 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  41.06 
 
 		 229 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  37.79 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  45.65 
 
 		 233 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  42.11 
 
 		 216 aa  140  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  42.27 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  45.36 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  45.41 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  45.36 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  42.03 
 
 		 210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  41.15 
 
 		 228 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  39.39 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  45.41 
 
 		 227 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  38.66 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  43.55 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  41.08 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  40.84 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  36.6 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  39.13 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  35.35 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  38.67 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  36.08 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  36.46 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  36.08 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  36.46 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  36.08 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  38.34 
 
 		 267 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  33.49 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  34.34 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  34.34 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  34.34 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  34.34 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  34.34 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  34.34 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  39.26 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  39.26 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  35.64 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  33.85 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  33.85 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  34.58 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  37.04 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  35.94 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  36.76 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  35.33 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  34.55 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  39.63 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  34.82 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  36.5 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  38.79 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  35.62 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  37.33 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  39.35 
 
 		 210 aa  104  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  35.19 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  35.51 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  35.19 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  35.19 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  35.19 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  36.51 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  35.19 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  34.26 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  33.95 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  39.59 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  34.6 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  33.95 
 
 		 214 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  33.02 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  32.71 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  33.33 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  36.45 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  34.76 
 
 		 215 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  34.76 
 
 		 215 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  32.87 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  32.02 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  32.7 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  35.51 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>