175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5480 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5480  OmpW  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.479641 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  58.11 
 
 		 236 aa  248  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  45.24 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  29.33 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1827  OmpW family protein  28.18 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  30.09 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  31.7 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  30.09 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  27.88 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  29.01 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  29.01 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  29.01 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  27.4 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  32.03 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  31.21 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  27.27 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  30.32 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  30.38 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  30.85 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  32.39 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  26.73 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  29.41 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  25.33 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  31.03 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  25 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  32.35 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  28.68 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  31.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  31.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  31.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  31.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  31.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  31.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  31.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  30.22 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  29.87 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  28.82 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  30.23 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  25.71 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  31.25 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  25.86 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  25.71 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  25.71 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  25.71 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  33.57 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  29.46 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  29.59 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  29.63 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  30.66 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  28.47 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  28.47 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  27.37 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  28.47 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  29.94 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  23 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  25 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  22.9 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  34.45 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  27.07 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  28.98 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  26.36 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  29.08 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  28.68 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  25.54 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  24.44 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  24.77 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  24.44 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  30.34 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  24.44 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  24.84 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  26.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  24.44 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  24.44 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  24.44 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  24.44 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  28.17 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  31.3 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  31.37 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  23.28 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  23.33 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  27.34 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  29.66 
 
 		 308 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  26.47 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  27.86 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  29.29 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  31.46 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  31.46 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  31.46 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  26.62 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  25.98 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  25.74 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  27.07 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  33.07 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  27.41 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  23.74 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  25.74 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  26.54 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  29.23 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  27.47 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>