183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3683 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  94.53 
 
 		 274 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  76.45 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  76.45 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  76.45 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  76.45 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  76.45 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  76.45 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  76.45 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  76.45 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  76.45 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  74.9 
 
 		 277 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  74.12 
 
 		 277 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  74.9 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  74.9 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  73.33 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  72.94 
 
 		 277 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  72.94 
 
 		 277 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  60.95 
 
 		 274 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  61.31 
 
 		 274 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  61.31 
 
 		 274 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  60.95 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  60.95 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  60.95 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  60.22 
 
 		 274 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  60.58 
 
 		 274 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  60.58 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  60.58 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  60.58 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  60.58 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  59.49 
 
 		 290 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  59.85 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  58.78 
 
 		 282 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  58.67 
 
 		 286 aa  331  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  58.39 
 
 		 274 aa  308  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  58.03 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  46.67 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  46.27 
 
 		 306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  39.64 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  41.67 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  37.92 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  36.8 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  37.55 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  36.82 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  36.82 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  38.41 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  38.41 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  38.41 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  36.82 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  36.82 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  36.82 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  36.82 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  36.82 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  36.74 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  38.17 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  36.29 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  37.4 
 
 		 243 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  36.76 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  37.16 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  36.36 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  37.16 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  36.16 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  36.16 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  34.77 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  35.79 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  33.33 
 
 		 464 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  33.33 
 
 		 464 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  33.33 
 
 		 464 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  34.77 
 
 		 246 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  31.94 
 
 		 463 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  32.84 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  30.53 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 498 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 498 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  30.56 
 
 		 498 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 498 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  30.56 
 
 		 498 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 504 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  31.16 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  30.58 
 
 		 371 aa  118  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  29.75 
 
 		 382 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  30.83 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  28.15 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  28.25 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  27.64 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  25.88 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  28 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  27.54 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  26.36 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  26.87 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  28.67 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  27.4 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  26.81 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  26.27 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  25.27 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  26.09 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  25.72 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  25.72 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  25.76 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  26.97 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>