182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3591 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  76.07 
 
 		 282 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  58.89 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  58.67 
 
 		 274 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  58.53 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  54.96 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  54.96 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  54.96 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  54.96 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  54.96 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  54.96 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  54.96 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  54.96 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  58.43 
 
 		 277 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  58.04 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  58.04 
 
 		 277 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  57.25 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  57.25 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  56.86 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  56.86 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  51.26 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  51.26 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  58.04 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  51.26 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  57.65 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  51.49 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  49.82 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  49.82 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  49.82 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  50 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  50 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  50 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  50 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  51.12 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  49.29 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  50.75 
 
 		 274 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  47.84 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  47.84 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  37.77 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  38.1 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  37.94 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  37.94 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  37.59 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  36.63 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  37.41 
 
 		 241 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  38.65 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  34.98 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  35.82 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  36.52 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  36.52 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  37.37 
 
 		 241 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  37.37 
 
 		 241 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  37.37 
 
 		 241 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  34.39 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  36.52 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  36.52 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  36.52 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  36.52 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  36.52 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  36.52 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  36.52 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  35.36 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 498 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 498 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 498 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  34.84 
 
 		 498 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  34.84 
 
 		 498 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  35.97 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  35.57 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  34.52 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  34.38 
 
 		 464 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  34.38 
 
 		 464 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  34.38 
 
 		 464 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  36.17 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  33.93 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 504 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  33.68 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  33.46 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  33.45 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  33.09 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  28.92 
 
 		 382 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  26.88 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  30.77 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  24.13 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  24.82 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  24.82 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  27.05 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  24.45 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  27.05 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  27.67 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  27.05 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  26.21 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  25.27 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  25.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  25.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  25.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  25.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  25.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  24.54 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  26.24 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>