196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0411 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  96.75 
 
 		 306 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  47.84 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  47.84 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  47.84 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  46.67 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  47.84 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  47.84 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  47.84 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  47.84 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  47.84 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  43.45 
 
 		 286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  45.88 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  47.45 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  45.88 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  46.27 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  45.49 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  45.49 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  45.1 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  45.49 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  45.1 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  45.88 
 
 		 282 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  44.71 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  47.06 
 
 		 274 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  44.71 
 
 		 274 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  44.71 
 
 		 274 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  43.92 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  43.92 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  43.92 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  47.45 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  47.06 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  45.1 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  45.1 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  45.1 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  45.1 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  45.1 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  44.71 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  44.71 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  35.66 
 
 		 504 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  34.93 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  34.93 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  34.93 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  34.93 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  34.93 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  34.93 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  35.53 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  35.53 
 
 		 464 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  35.53 
 
 		 464 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  35.53 
 
 		 464 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  38.87 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  36.69 
 
 		 239 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  36.29 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  37.65 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  37.9 
 
 		 241 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  32.17 
 
 		 382 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  33.88 
 
 		 243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  33.88 
 
 		 243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  33.88 
 
 		 243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  33.88 
 
 		 243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  33.88 
 
 		 243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  33.88 
 
 		 243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  33.88 
 
 		 243 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  35.63 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  35.63 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  35.63 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  31.3 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  33.06 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  33.2 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  33.06 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  33.99 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  31.45 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  35.2 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  33.73 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  31.27 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  31.27 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  31.85 
 
 		 246 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  32.8 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  32.8 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  30.94 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  30.14 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  29.15 
 
 		 245 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  29.33 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  26.87 
 
 		 210 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  27.07 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  31.1 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  27.24 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  26.83 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  26.83 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  26.83 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  26.83 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  26.83 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  26.83 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.29 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.29 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  27.32 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  27.32 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  27.32 
 
 		 212 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  31.58 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  27.54 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  27.54 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>