183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0273 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  94.53 
 
 		 274 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  78.47 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  78.47 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  78.1 
 
 		 276 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  78.47 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  78.47 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  78.47 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  78.47 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  78.47 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  78.47 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  75.29 
 
 		 277 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  74.9 
 
 		 277 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  75.29 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  74.51 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  74.12 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  74.12 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  74.51 
 
 		 277 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  60.95 
 
 		 274 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  60.95 
 
 		 274 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  60.58 
 
 		 274 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  60.58 
 
 		 274 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  60.58 
 
 		 274 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  59.85 
 
 		 274 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  59.85 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  60.22 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  60.22 
 
 		 290 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  60.22 
 
 		 290 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  60.22 
 
 		 290 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  60.22 
 
 		 290 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  59.12 
 
 		 290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  59.49 
 
 		 274 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  59.85 
 
 		 282 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  58.89 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  58.03 
 
 		 274 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  58.03 
 
 		 274 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  45.88 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  45.88 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  41.3 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  39.05 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  38.95 
 
 		 241 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  37.92 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  38.29 
 
 		 241 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  37.82 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  37.82 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  37.82 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  37.55 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  37.15 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  37.5 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  40.08 
 
 		 243 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  38.37 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  38.37 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  38.37 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  38.37 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  38.37 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  38.37 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  38.37 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  38.55 
 
 		 243 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  37.9 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  37.23 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  38.31 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  37.23 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  38.31 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  36.88 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  34.38 
 
 		 464 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  34.38 
 
 		 464 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  34.38 
 
 		 464 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  36.07 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  33.94 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  32.99 
 
 		 463 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  32.46 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  31.64 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  30.88 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  31.36 
 
 		 498 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  31.36 
 
 		 498 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  31.36 
 
 		 498 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  31.36 
 
 		 498 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  31.36 
 
 		 498 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  30.9 
 
 		 504 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  31.82 
 
 		 371 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  28.73 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  31.2 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  28.57 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  26.81 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  26.28 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  29.09 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  28.36 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  26.94 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  28.57 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  27.88 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  25.49 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  28 
 
 		 210 aa  72  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  28 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  26.07 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  26.94 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  25 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  25.46 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  27.74 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  25.91 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  26.09 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>