201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2417 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  100 
 
 
274 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  99.27 
 
 
274 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  69.34 
 
 
274 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  69.34 
 
 
274 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  68.25 
 
 
274 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  67.88 
 
 
274 aa  391  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  68.61 
 
 
274 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  68.61 
 
 
274 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  68.61 
 
 
274 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  68.98 
 
 
274 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  68.61 
 
 
274 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  68.98 
 
 
290 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  68.98 
 
 
290 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  68.98 
 
 
290 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  68.98 
 
 
290 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  68.25 
 
 
290 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  58.03 
 
 
274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  58.03 
 
 
274 aa  338  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  55.6 
 
 
286 aa  321  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  56.2 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  56.2 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  56.2 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  56.2 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  56.2 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  56.2 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  56.2 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  56.2 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  56.2 
 
 
276 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  55.34 
 
 
282 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  56.47 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  56.08 
 
 
277 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  56.86 
 
 
277 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  55.69 
 
 
277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  56.08 
 
 
277 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  55.29 
 
 
277 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  55.29 
 
 
277 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  47.45 
 
 
306 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  47.45 
 
 
308 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  36.13 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  36.96 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  38.08 
 
 
241 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  35.4 
 
 
241 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  34.39 
 
 
239 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  35.84 
 
 
241 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  36.97 
 
 
241 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  36.97 
 
 
241 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  33.99 
 
 
239 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  36.97 
 
 
241 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  35.13 
 
 
241 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  34.7 
 
 
240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  36.02 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  34.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  34.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  33.95 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  34.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  33.95 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  33.95 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  34.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  34.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  34.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  34.36 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  32.17 
 
 
277 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  32.41 
 
 
498 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  32.41 
 
 
498 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  32.41 
 
 
498 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  32.41 
 
 
498 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  32.41 
 
 
498 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  34.1 
 
 
243 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  33.1 
 
 
463 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  32.41 
 
 
504 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  34.12 
 
 
243 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  33.97 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  33.97 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  32.86 
 
 
246 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  32.41 
 
 
464 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  32.41 
 
 
464 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  32.41 
 
 
464 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  32.34 
 
 
246 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  30.35 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  29.05 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  27.6 
 
 
382 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  30.37 
 
 
248 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  29.35 
 
 
217 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  29.26 
 
 
214 aa  92.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  27.41 
 
 
213 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  28.36 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  26.09 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  26.09 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  26.01 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  25.75 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  26.22 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  25.72 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  26.49 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  26.49 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  25.82 
 
 
211 aa  79  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  25.37 
 
 
215 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  27.01 
 
 
213 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  24.64 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  24.64 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  25.74 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>