185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0230 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  100 
 
 
277 aa  557  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  98.92 
 
 
277 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  95.67 
 
 
277 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  96.75 
 
 
277 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  95.31 
 
 
277 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  95.31 
 
 
277 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  88.81 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  88.81 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  88.81 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  88.81 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  88.81 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  88.81 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  88.81 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  88.81 
 
 
276 aa  497  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  88.81 
 
 
276 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  93.5 
 
 
277 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  72.92 
 
 
274 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  72.2 
 
 
274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  59.93 
 
 
274 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  59.93 
 
 
274 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  59.93 
 
 
274 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  59.57 
 
 
274 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  59.93 
 
 
274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  59.93 
 
 
274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  57.55 
 
 
274 aa  329  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  58.27 
 
 
274 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  58.27 
 
 
290 aa  321  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  58.27 
 
 
290 aa  321  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  58.27 
 
 
290 aa  321  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  58.27 
 
 
290 aa  321  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  57.91 
 
 
290 aa  321  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  57.91 
 
 
274 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  56.16 
 
 
282 aa  316  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  56.27 
 
 
286 aa  315  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  56.47 
 
 
274 aa  291  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  56.47 
 
 
274 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  45.1 
 
 
306 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  45.1 
 
 
308 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  39.57 
 
 
241 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  40.29 
 
 
240 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  40.07 
 
 
241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  38.13 
 
 
241 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  39.38 
 
 
243 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  39.38 
 
 
243 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  39.38 
 
 
243 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  39.38 
 
 
243 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  39.38 
 
 
243 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  39.38 
 
 
243 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  39.38 
 
 
243 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  38.49 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  39.92 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  39.92 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  39.92 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  38.31 
 
 
243 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  38.19 
 
 
239 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  37.25 
 
 
243 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  37.8 
 
 
239 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  37.93 
 
 
241 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  37.55 
 
 
243 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  36.27 
 
 
243 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  36.27 
 
 
243 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  37.41 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  37.16 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  37.16 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  36.92 
 
 
246 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  35.11 
 
 
243 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  32.66 
 
 
464 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  32.66 
 
 
464 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  32.66 
 
 
464 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  35.27 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  31.31 
 
 
463 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  32.82 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  29.72 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  29.55 
 
 
498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  29.55 
 
 
498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  29.55 
 
 
498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  29.55 
 
 
498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  29.55 
 
 
498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  29.79 
 
 
504 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  32.82 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  30.36 
 
 
382 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  28.51 
 
 
371 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  30.94 
 
 
228 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  31.05 
 
 
210 aa  87  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  29.03 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  26.62 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  26.74 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  28.57 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  29.24 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  25.63 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  24.91 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  28.06 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  28.06 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  27.56 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  26.95 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  24.19 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  25.27 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  27.24 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  25.27 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  26.6 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>