117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2349 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  100 
 
 		 382 aa  777    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  60.82 
 
 		 371 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  32.17 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  32.17 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  32.11 
 
 		 277 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  30.22 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  30.22 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  30.36 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  30.22 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  30.22 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  30.22 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  30.22 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  30.22 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  30.22 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  28.92 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  31.29 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  30.36 
 
 		 277 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  30.36 
 
 		 277 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  30.36 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  30.36 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  29.96 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  29.15 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  29.75 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  30.08 
 
 		 274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  28.73 
 
 		 274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  28.33 
 
 		 274 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  28.33 
 
 		 274 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  27.13 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  27.91 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  27.91 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  27.91 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  27.6 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  28.46 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  28.46 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  27.6 
 
 		 274 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  28.46 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  28.46 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  28.46 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  28.46 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  30.29 
 
 		 241 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  28.05 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  24.71 
 
 		 463 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  28.46 
 
 		 241 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  28.46 
 
 		 241 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  28.46 
 
 		 241 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  27.2 
 
 		 240 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  24.32 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  24.32 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  24.32 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 504 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  26.94 
 
 		 243 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  26.94 
 
 		 243 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  26.94 
 
 		 243 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  26.94 
 
 		 243 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  26.94 
 
 		 243 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  26.94 
 
 		 243 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  26.94 
 
 		 243 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  29.6 
 
 		 241 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  27.24 
 
 		 243 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  25.41 
 
 		 241 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  28.1 
 
 		 239 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  28.1 
 
 		 239 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  28.86 
 
 		 243 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  28.86 
 
 		 243 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  28.86 
 
 		 243 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  26.23 
 
 		 241 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  29.15 
 
 		 243 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  24.71 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  27.94 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  26.83 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  28.57 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  28.57 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  24.62 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  24.62 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  26.03 
 
 		 241 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  25.62 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  24.68 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  25.1 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  24.69 
 
 		 245 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  27.71 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  26.07 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  22.61 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  24.14 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  25.55 
 
 		 206 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  23.25 
 
 		 223 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  24.67 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  22.31 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  22.37 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  24.84 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  23.43 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  20.49 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  25.31 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  26.45 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  26.8 
 
 		 210 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  27.1 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  22.88 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  21.21 
 
 		 213 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>