211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4189 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5480  OmpW  58.11 
 
 		 234 aa  261  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.479641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  49.78 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  30.74 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  30.84 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  33.48 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  30.84 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  36.77 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  36.77 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  36.77 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  30.86 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  27.91 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  28.91 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  28.64 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  33.74 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  28.44 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  33.13 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1827  OmpW family protein  30.05 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  31.28 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  27.35 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  27.18 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  34.87 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  33.99 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  28.64 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  28.64 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  28.64 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  31.52 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  28.64 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  28.64 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  29 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  26.7 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  31.52 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  28.64 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  28.64 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  30.91 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  27.02 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  32.65 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  33.83 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  33.79 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  26.53 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  29.17 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  29.17 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  29.17 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  33.99 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  29.17 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  31.08 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  29.17 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  30.8 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  29.17 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  29.17 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  29.17 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  31.08 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  33.09 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  31.69 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  33.09 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  28.7 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  28 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  31.58 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  31.13 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  31.43 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  28.11 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  27.36 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  29.33 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  33.59 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  31.4 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  31.4 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  33.33 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  30 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  27.34 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  31.91 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  33.33 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  29.18 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  31.4 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  32.31 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  28.24 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  30.37 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  31.4 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  28.34 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  30.69 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  33.9 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  31.4 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  30.69 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  29.19 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  29.66 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  26.67 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  26.74 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  27.78 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  26.15 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  27.31 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  27.81 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  30.07 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  27.78 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  27.78 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  28.76 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  30.16 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  27.78 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  29.56 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  30.16 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  34.44 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  34.44 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>