231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0029 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 
237 aa  473  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  47.06 
 
 
227 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  45 
 
 
224 aa  202  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  43.09 
 
 
232 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  43.09 
 
 
232 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  45.04 
 
 
213 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  44.07 
 
 
218 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  42.44 
 
 
210 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  40.33 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  43.39 
 
 
228 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  45.41 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  41.6 
 
 
210 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  39.33 
 
 
214 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  41.1 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  41.74 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  39.75 
 
 
213 aa  161  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  42.11 
 
 
232 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  41.77 
 
 
215 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  41.77 
 
 
215 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  41.32 
 
 
214 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  42.86 
 
 
223 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  40.16 
 
 
215 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  41.77 
 
 
214 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  40.17 
 
 
214 aa  158  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  40.34 
 
 
210 aa  158  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  40.33 
 
 
215 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  40.34 
 
 
210 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  40.59 
 
 
212 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  40.59 
 
 
212 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  40.59 
 
 
212 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  40.59 
 
 
212 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  40.59 
 
 
212 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  39.17 
 
 
217 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  40.17 
 
 
212 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  41.28 
 
 
227 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  41.1 
 
 
214 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  39.83 
 
 
214 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  39.83 
 
 
214 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  39.92 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  40.17 
 
 
212 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  41.67 
 
 
227 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  40.17 
 
 
212 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  42.08 
 
 
227 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  40.17 
 
 
212 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  38.91 
 
 
211 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  40.25 
 
 
212 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  40.25 
 
 
212 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  39.08 
 
 
211 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  38.49 
 
 
211 aa  148  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  38.49 
 
 
211 aa  148  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  40.74 
 
 
227 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  39.83 
 
 
212 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  39.42 
 
 
212 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  39.42 
 
 
212 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  38.4 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  37.97 
 
 
224 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  40.74 
 
 
227 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  39.33 
 
 
202 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  40.55 
 
 
216 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  40.17 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  37.13 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  37.5 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  36.89 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  39.56 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  36.78 
 
 
218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  34.84 
 
 
209 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  34.03 
 
 
206 aa  118  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  34.58 
 
 
195 aa  118  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  34.58 
 
 
195 aa  118  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  34.3 
 
 
200 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  34.42 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  33.2 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  34.42 
 
 
201 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  34.62 
 
 
211 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  34.17 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  35.48 
 
 
209 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  32.71 
 
 
209 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  32.85 
 
 
200 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  36.24 
 
 
211 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  37.61 
 
 
209 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  34.11 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  30.29 
 
 
227 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  30.83 
 
 
198 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  37.27 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  30.04 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  32.79 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  32.78 
 
 
219 aa  85.5  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  29.49 
 
 
198 aa  85.5  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  28.35 
 
 
241 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  29.75 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  29.46 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  31.31 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  30.46 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  28.63 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  27.78 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  29.46 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  30.83 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  29.24 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  31.91 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  31.91 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>