232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0319 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  95.06 
 
 		 243 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  95.06 
 
 		 243 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  94.24 
 
 		 243 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  90.53 
 
 		 243 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  89.3 
 
 		 243 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  75.31 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  75.31 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  75.31 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  75.31 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  75.31 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  75.31 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  75.31 
 
 		 243 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  76.13 
 
 		 243 aa  370  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  61.32 
 
 		 241 aa  307  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  60.49 
 
 		 241 aa  305  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  57.2 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  47.76 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  51.33 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  50.23 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  49.77 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  46.5 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  47.22 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  47.22 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  47.22 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  45.78 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  41.3 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  41.7 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  39.83 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  36.63 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  36.04 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  36.9 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  36.4 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  36.4 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  37.59 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  36.4 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  36.52 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  36.05 
 
 		 277 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  35.66 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  37.45 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  35.66 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  34.5 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  34.43 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  34.11 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  34.11 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  31.67 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  31.32 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  31.32 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  30.96 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  30.96 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  30.96 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  34.07 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  34.07 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  34.07 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  34.07 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  34.07 
 
 		 274 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  34.07 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  33.82 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  33.98 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  33.98 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  33.2 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  32.8 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  32.13 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  29.46 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  28.8 
 
 		 371 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  31.6 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  29.22 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  29.91 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  29.91 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  28.57 
 
 		 382 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  30.45 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  30.04 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  28.51 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  28.86 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  30.49 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  27.13 
 
 		 215 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  28.16 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  28.83 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  27.98 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  28.32 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  29.17 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  26.14 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  28.93 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  31.05 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  28.76 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  27.16 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  26.83 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  27.16 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  27.66 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  29.87 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  27.76 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  29.82 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  27.57 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>