230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5285 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  70.9 
 
 		 246 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  70.08 
 
 		 246 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  46.02 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  45 
 
 		 241 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  42.33 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  42.33 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  40.17 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  40.81 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  40.81 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  40.36 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  41.07 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  39.91 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  39.91 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  36.97 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  39.91 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  39.37 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  39.37 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  39.37 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  39.37 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  39.37 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  39.37 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  39.37 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  36.4 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  36.97 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  40.37 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  37.39 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  37.04 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  37.04 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  37.04 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  31.64 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  35.54 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  33.2 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  33.46 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  33.07 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  33.46 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  33.09 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  30.62 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  33.07 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  33.07 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  32.68 
 
 		 277 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  30.74 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  32.43 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  32.68 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  31.16 
 
 		 274 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  30.62 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  30.62 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  30.62 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  31.13 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  29.84 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  29.84 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  31.13 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  31.13 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  31.13 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  31.13 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  30.74 
 
 		 290 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  31.01 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  29.74 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  30.08 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  30.08 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  29.96 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  29.15 
 
 		 308 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  28.51 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  28.51 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  28.83 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  32.7 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  28.96 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  27.54 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  30.86 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  28.19 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  29.22 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  27.24 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  24.77 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  28.05 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  30.29 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  25.7 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  28.51 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  25.7 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  28.12 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  28.51 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  28.51 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  27.31 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  28.12 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  25.53 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  28.51 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  25.56 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  26.82 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  28.57 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  29.02 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  28.09 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  27.75 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  28.09 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  28 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>