226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0194 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  100 
 
 		 227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  53.14 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  51.92 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  44.55 
 
 		 224 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  37.05 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  37.1 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  34.76 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  36.04 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  36.91 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  37.05 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  34.63 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  35.19 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  35.62 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  35.62 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  33.48 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  31.28 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  35.62 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  36.61 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  35.43 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  35.27 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  32.33 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  32.39 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  33.03 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  34.38 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  31.03 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  33.91 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  33.91 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  32.48 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  35.43 
 
 		 210 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  34.3 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  35.43 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  35.37 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  33.04 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  31.67 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  33.19 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  32.31 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  32.31 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  33.79 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  31.88 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  29.2 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  34.65 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  31.44 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  31.44 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  31.44 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  31.44 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  31.44 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  31.44 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  31.74 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  33.19 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  33.02 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  29.6 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  29.6 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  29.6 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  31.8 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  30.6 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  30.8 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  31.6 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  32.18 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  31.6 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  31.28 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  30.09 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  31.9 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  32.23 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  30.04 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  31.29 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  30.67 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  30.86 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  31.43 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  29.05 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  29.05 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  29.05 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  31.74 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  33.49 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  26.99 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  29 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  29.63 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  28.63 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  30.36 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  31.55 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  31.55 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  30.36 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  25.98 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  29.96 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  29.96 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  28.69 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  29.28 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  30.48 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  29.05 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  27.27 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  30.96 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  26.19 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  28.07 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  28.07 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  31.53 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  30.2 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  30.94 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>