232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0539 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  98.24 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  95.59 
 
 		 227 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  95.59 
 
 		 227 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  77.19 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  77.07 
 
 		 228 aa  339  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  67.67 
 
 		 232 aa  314  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  67.24 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  57.52 
 
 		 226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  57.02 
 
 		 224 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  57.76 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  62.77 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  47.16 
 
 		 214 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  47.62 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  44.44 
 
 		 211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  49.34 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  44 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  44 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  44.54 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  46.29 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  43.67 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  44.78 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  45.18 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  45.02 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  45.85 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  47.47 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  46.98 
 
 		 213 aa  191  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  45.02 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  44.44 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  44.44 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  44.44 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  46.75 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  44.44 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  44.44 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  44.44 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  44.44 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  44.44 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  44.44 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  44.95 
 
 		 210 aa  187  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  45.41 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  45.45 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  44.7 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  43.48 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  44.64 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  44.64 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  45.92 
 
 		 214 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  45.92 
 
 		 214 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  45.87 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  45.54 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  46.15 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  46.58 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  44.05 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  44.05 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  44.05 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  44.05 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  43.61 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  43.61 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  42.29 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  42.32 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  41.85 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  41.67 
 
 		 203 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  46.32 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  40 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  38.32 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  37.02 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  37.28 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  35.47 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  39.11 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  37.07 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  35.64 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  35.64 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  36.16 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  37.93 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  34.02 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  34.45 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1244  OmpW  31.8 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000847221  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  34.62 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  35.75 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  31.34 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0194  OmpW  33.18 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  34.25 
 
 		 200 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  31.92 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  32.23 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  35.65 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  31.3 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  30.83 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  28.24 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  29.61 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  27.78 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  30.9 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  28.63 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  37.04 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  31.36 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  31.36 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  36.42 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  31.36 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  31.36 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  31.36 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  31.36 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  32.33 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>