169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5385 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  46.39 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  41.24 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  41.8 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  43.39 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  39.38 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  38.61 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  41.88 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  40.96 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  40.96 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  40.21 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  38.3 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  37.76 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  37.76 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  37.76 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  37.76 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  37.76 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  37.76 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  37.76 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  37.76 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  40.53 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  34.53 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  39.09 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  38.66 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  39.38 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  39.38 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  39.38 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  34.52 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  39.38 
 
 		 213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  39.38 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  37.5 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  34.9 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  34.69 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  33.85 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  34.38 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  32.08 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  33.16 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  30.8 
 
 		 219 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  31.53 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  29.67 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  36.53 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  36.15 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  30.61 
 
 		 267 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  31.08 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  35.68 
 
 		 224 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  31.39 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  35.35 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  34.26 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  34.2 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  36.97 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  31.78 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  30.63 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  32.87 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  34.43 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  34.43 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  31.98 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  37.7 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  31.96 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  34.18 
 
 		 245 aa  97.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  36.11 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  33.67 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  31.36 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  32.72 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  31.37 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  30.29 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  31.36 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  30.77 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  32.59 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  32.59 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  32.59 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  32.59 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  32.59 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  29.13 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  32.59 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  32.14 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  30.26 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  28.31 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  29.22 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  32.13 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  32.14 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  32.14 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  32.14 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  29.02 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  31.25 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  31.25 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  31.25 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  31.25 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  34.22 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  31.25 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  30.49 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  30.52 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  31.3 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  29.15 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  30.15 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  29.08 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  30.15 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  28.51 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  30.65 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  29.09 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  28.64 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>