196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5886 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  100 
 
 		 245 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  67.45 
 
 		 216 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  52.11 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  51.58 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  51.05 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  51.24 
 
 		 195 aa  187  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  51.24 
 
 		 195 aa  187  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  47.83 
 
 		 204 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  47.15 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  46.36 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  43.38 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  50 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  45.02 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  42.33 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  39.41 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  41.4 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  43.89 
 
 		 196 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  43.37 
 
 		 210 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  36.84 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  40.53 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  37.73 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  41.97 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  41.27 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  39.32 
 
 		 230 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  40 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  37.38 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  37.38 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  37.38 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  37.38 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  37.38 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  36.8 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  39.46 
 
 		 213 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  38.71 
 
 		 216 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  40.31 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  38.18 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  36.92 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  38.35 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  37.88 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  39.91 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  37.88 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  37.88 
 
 		 213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  36.2 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  37.88 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  37.88 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  40.41 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  39.13 
 
 		 194 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  40.41 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  39.06 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  36.7 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  39.13 
 
 		 194 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  42.21 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  39.38 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  33.93 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  37.5 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  34.54 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  32.47 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  32.44 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  35.75 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  36.08 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  31.34 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  33.01 
 
 		 202 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  34.55 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  34.09 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  34.55 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  34.55 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  34.55 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  32.54 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  34.56 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  34.56 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  34.08 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  34.56 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  33.66 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  34.21 
 
 		 202 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  32.39 
 
 		 217 aa  99  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  33.49 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  33.49 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  34.18 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  33.66 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  32.71 
 
 		 214 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  36.45 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  33.5 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  33.81 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  32.73 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  32.87 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  32.66 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  30.84 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  31.19 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  36.47 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  36.47 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  36.47 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  36.47 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  36.47 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  36.47 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  29.35 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  31.82 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  35.88 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  35.88 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  35.88 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>