123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1749 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  93.36 
 
 		 226 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1545  OmpW family protein  81.98 
 
 		 238 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281829  normal  0.0125909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  36.27 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  39.79 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  34.59 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  34.98 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  33.68 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  33.02 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  35.68 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  32.8 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  35.33 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  38.17 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  30 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  32.43 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  37.42 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  33.7 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  33.7 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  33.7 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  32.83 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  35.06 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  31.15 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  32.31 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  31.22 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  31.16 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  34.42 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  31.98 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  29.26 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  31.98 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  35.53 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  35.53 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  28.05 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  33.55 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  30.81 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  29.73 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  25.89 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  32.89 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  30.73 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  30.24 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  30.73 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  30.73 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  30.24 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  30.1 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  29.41 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  28.11 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  30.53 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  28.43 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  29.8 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  26.88 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  29.38 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  32.24 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  27.55 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  28.11 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  29.38 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  29.38 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  29.38 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  29.38 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  29.38 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  28.99 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  28.99 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  27.73 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  29.41 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  27.47 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  33.33 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  30 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  27.17 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  26.09 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  29.24 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  34.65 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  27.52 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  26.58 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  30.56 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  24.37 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  27.11 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  27.98 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  26.35 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  27.46 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  26.35 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  28.23 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  27.33 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  26.6 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  25.58 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  24.75 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  25.58 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  26.42 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  25.65 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  25.58 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  24.78 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  27.88 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  26.18 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  27.62 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  28.8 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  28.8 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  25.65 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  25.65 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  25.37 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1909  OmpW family protein  27.44 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000171006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1977  outer membrane protein  27.44 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.000000000000671005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  22.29 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03097  outer membrane protein  25.49 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>