More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3005 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013206  Aaci_3005  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 391 aa  795    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0494623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.12 
 
 		 374 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.44 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.85 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.49 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.49 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.76 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.08 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.04 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.63 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.04 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  28.04 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.04 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  28.16 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.16 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.89 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  28.84 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.2 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  27.2 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  30.06 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.39 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  29.83 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  24.43 
 
 		 374 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  30.17 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.76 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  28.77 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.86 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.76 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.42 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.6 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  27.74 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  27.74 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  22.89 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.25 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.25 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  25.72 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.95 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  27.9 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.34 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.96 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.67 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  26.17 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  25.98 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.98 
 
 		 366 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.71 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  27.23 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.75 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.08 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.28 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  25.47 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  23.04 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.01 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  27.63 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.7 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.93 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 		 370 aa  96.3  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  24.34 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  25.61 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.05 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  22.11 
 
 		 376 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  23.96 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  22.97 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  25.73 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.97 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.3 
 
 		 367 aa  94.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.78 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  24.94 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.74 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 367 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  23.2 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.02 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  22.48 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.53 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.24 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  24.15 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.53 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.46 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.59 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  24.25 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  24.78 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.65 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.23 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.85 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1752  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.236146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.89 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.41 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000000103313  normal  1 
 
 
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  25.07 
 
 		 362 aa  90.5  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>