88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1668 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1668  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  506  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1674  hypothetical protein  97.93 
 
 
241 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  31.66 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  31.33 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  25.13 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  20.86 
 
 
322 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  25.93 
 
 
253 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  27.13 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  26.92 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  25.47 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  25.41 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  25.41 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  23.57 
 
 
289 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  24.02 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  24.88 
 
 
307 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0828  spermine synthase  30.32 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  23.38 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  23.89 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  26.35 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  23.04 
 
 
281 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  25.79 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.69 
 
 
308 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  25.79 
 
 
276 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  25.79 
 
 
284 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  23.71 
 
 
264 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  24.58 
 
 
235 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  24.58 
 
 
235 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  25.93 
 
 
247 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  23.71 
 
 
264 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.64 
 
 
558 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  25.68 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  25.68 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  25.16 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  25.84 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  25.93 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  22.6 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  22.43 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  29.68 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  28.24 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  24.11 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  26.35 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  25.4 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  26.35 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  28.17 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  26.35 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  24.6 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  25.9 
 
 
259 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  21.14 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  24.69 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  20.48 
 
 
516 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  23.66 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  26.37 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  22.56 
 
 
256 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  22.9 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  21.23 
 
 
281 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  24.06 
 
 
278 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  24.06 
 
 
278 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  23.7 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  25.26 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  25.3 
 
 
262 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  26.8 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  21.55 
 
 
295 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  22.63 
 
 
551 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  24.43 
 
 
315 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  26.7 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  24.81 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  23.08 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  21.67 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  28.29 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  21.9 
 
 
548 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  27.41 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  27.81 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  20.69 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  20.69 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  27.92 
 
 
364 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  23.9 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  25.18 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  28.44 
 
 
274 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  27.87 
 
 
705 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  27.87 
 
 
705 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  27.63 
 
 
305 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  22.07 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  25.45 
 
 
286 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  28.92 
 
 
221 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  25.26 
 
 
259 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  24.32 
 
 
305 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  21.12 
 
 
285 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  24.35 
 
 
295 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>