More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0804 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  713    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.11 
 
 
313 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 
310 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  22.74 
 
 
338 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 
338 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  20.92 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  22.51 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  21.54 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  29.76 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  21.95 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.71 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  21.36 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.13 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  21.14 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  25.08 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.55 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  20.6 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  21.05 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.62 
 
 
778 aa  64.7  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  23.25 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  26.58 
 
 
279 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2817  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  30.12 
 
 
434 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.53 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  21.38 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.92 
 
 
380 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.36 
 
 
297 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1838  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 
491 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 
287 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  21.61 
 
 
340 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3811  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  22.69 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  23.08 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.9 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  26.06 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
782 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  28.97 
 
 
386 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.55 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.91 
 
 
395 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.85 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.85 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  21.61 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.57 
 
 
368 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 
471 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  22.12 
 
 
384 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
458 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  29.37 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 
471 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.85 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.86 
 
 
323 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.67 
 
 
389 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.46 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0405  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.78 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.98 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.54 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.47 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.36 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  23.88 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 
446 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.54 
 
 
324 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  20.2 
 
 
338 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  26.52 
 
 
379 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 
356 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 
470 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.37 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
496 aa  52.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.17 
 
 
371 aa  52.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.94 
 
 
414 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0401  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.8 
 
 
376 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.17 
 
 
317 aa  52.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.82 
 
 
384 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2153  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.57 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.666004  normal  0.11423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  23.4 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>