31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3811 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3811  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  29.2 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.59 
 
 
358 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.59 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.04 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
329 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.74 
 
 
323 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  26.75 
 
 
338 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  20.26 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  19.38 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.78 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0257  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20.34 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.862128  normal  0.0494726 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  19.47 
 
 
317 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20 
 
 
333 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 
265 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.22 
 
 
348 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.35 
 
 
342 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.35 
 
 
342 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
368 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  21 
 
 
340 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  20.35 
 
 
366 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>