287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0670 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3870  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  99.62 
 
 
792 aa  1619    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1631  putative fimbrial usher protein  42.46 
 
 
855 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3782  fimbrial usher protein  99.62 
 
 
792 aa  1621    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0163  fimbrial usher family protein  42.46 
 
 
789 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0670  fimbrial usher protein  100 
 
 
792 aa  1626    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0189299  normal  0.787892 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0491  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.32 
 
 
793 aa  287  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4928  fimbrial usher protein  27.61 
 
 
802 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2406  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.69 
 
 
812 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4894  fimbrial usher protein  27.61 
 
 
802 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4980  fimbrial usher protein  27.61 
 
 
802 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.69 
 
 
783 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.89 
 
 
830 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.89 
 
 
830 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1679  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.75 
 
 
847 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4479  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.78 
 
 
913 aa  197  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.27 
 
 
852 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  25.06 
 
 
833 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  24.6 
 
 
833 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  25.34 
 
 
833 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  25.13 
 
 
850 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.52 
 
 
870 aa  172  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  25.64 
 
 
870 aa  172  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  25.25 
 
 
866 aa  170  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  25.13 
 
 
866 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  25 
 
 
861 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.31 
 
 
865 aa  167  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.58 
 
 
819 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.82 
 
 
850 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.15 
 
 
866 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  25.73 
 
 
839 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.63 
 
 
887 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.5 
 
 
844 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.03 
 
 
867 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.79 
 
 
872 aa  154  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.6 
 
 
1040 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.36 
 
 
828 aa  154  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  23.2 
 
 
866 aa  154  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.43 
 
 
864 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.77 
 
 
850 aa  151  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.55 
 
 
828 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.55 
 
 
828 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  24.13 
 
 
851 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.42 
 
 
828 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.56 
 
 
852 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.42 
 
 
817 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.61 
 
 
829 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  24.62 
 
 
837 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.94 
 
 
837 aa  147  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.12 
 
 
828 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.16 
 
 
831 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.69 
 
 
832 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.02 
 
 
833 aa  145  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  22.67 
 
 
866 aa  144  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.65 
 
 
841 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.29 
 
 
886 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  23.94 
 
 
865 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  24.88 
 
 
913 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.61 
 
 
836 aa  141  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  24.88 
 
 
914 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.41 
 
 
875 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.18 
 
 
861 aa  141  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.41 
 
 
875 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  26.38 
 
 
939 aa  140  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  24.66 
 
 
914 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  25.15 
 
 
870 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  25.03 
 
 
848 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  23.18 
 
 
888 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  25.09 
 
 
839 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  24.08 
 
 
872 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  24.04 
 
 
844 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.22 
 
 
852 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  23.86 
 
 
866 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  24.38 
 
 
848 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.13 
 
 
880 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.9 
 
 
853 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.4 
 
 
859 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  25.21 
 
 
829 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  25.36 
 
 
829 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  25.36 
 
 
829 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.46 
 
 
963 aa  131  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  24.47 
 
 
826 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.64 
 
 
819 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  22.05 
 
 
853 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  23.64 
 
 
833 aa  131  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  22.35 
 
 
853 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  25.12 
 
 
829 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  23.03 
 
 
822 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  23.39 
 
 
816 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  22.75 
 
 
812 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  24.79 
 
 
833 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  25.24 
 
 
829 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.79 
 
 
821 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  23.52 
 
 
833 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.34 
 
 
826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  24.47 
 
 
826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.58 
 
 
832 aa  129  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  22.24 
 
 
853 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  23.12 
 
 
833 aa  128  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  23.45 
 
 
885 aa  128  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  23.29 
 
 
834 aa  128  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>