268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1631 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3870  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.46 
 
 		 792 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1631  putative fimbrial usher protein  100 
 
 		 855 aa  1739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0670  fimbrial usher protein  42.46 
 
 		 792 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0189299  normal  0.787892 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0163  fimbrial usher family protein  99.75 
 
 		 789 aa  1599    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3782  fimbrial usher protein  42.46 
 
 		 792 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0491  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.3 
 
 		 793 aa  264  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.83 
 
 		 830 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.83 
 
 		 830 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1679  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.48 
 
 		 847 aa  237  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.63 
 
 		 783 aa  232  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2406  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.16 
 
 		 812 aa  226  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4479  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.03 
 
 		 913 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4894  fimbrial usher protein  27.5 
 
 		 802 aa  214  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4928  fimbrial usher protein  27.12 
 
 		 802 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4980  fimbrial usher protein  27.16 
 
 		 802 aa  211  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  25 
 
 		 833 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  25.06 
 
 		 833 aa  177  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  25 
 
 		 850 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  24.94 
 
 		 833 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  26.71 
 
 		 913 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  27.23 
 
 		 914 aa  173  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  26.91 
 
 		 914 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.48 
 
 		 844 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.57 
 
 		 852 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  26.72 
 
 		 939 aa  170  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.8 
 
 		 866 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.76 
 
 		 872 aa  168  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.52 
 
 		 835 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.88 
 
 		 850 aa  167  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.56 
 
 		 852 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  26.7 
 
 		 839 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.05 
 
 		 853 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.28 
 
 		 837 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  24.66 
 
 		 833 aa  157  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  23.83 
 
 		 866 aa  157  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.73 
 
 		 890 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.47 
 
 		 930 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.86 
 
 		 884 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.55 
 
 		 861 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.21 
 
 		 828 aa  151  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.03 
 
 		 852 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.28 
 
 		 832 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  23.84 
 
 		 839 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  23.88 
 
 		 842 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25 
 
 		 831 aa  144  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  23.77 
 
 		 842 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.38 
 
 		 875 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.54 
 
 		 866 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.48 
 
 		 886 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.38 
 
 		 875 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  23.76 
 
 		 842 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.6 
 
 		 851 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  25.09 
 
 		 866 aa  142  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  25.96 
 
 		 837 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  23.13 
 
 		 866 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.69 
 
 		 857 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.3 
 
 		 880 aa  140  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  23.01 
 
 		 866 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.37 
 
 		 841 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886847 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.2 
 
 		 865 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  23.01 
 
 		 861 aa  138  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  23.33 
 
 		 888 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  25.22 
 
 		 865 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  23.68 
 
 		 863 aa  137  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  24.77 
 
 		 872 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.04 
 
 		 901 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.97 
 
 		 819 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  24.13 
 
 		 822 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  24.13 
 
 		 812 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.39 
 
 		 821 aa  134  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  23.13 
 
 		 885 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  23.13 
 
 		 885 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  23.57 
 
 		 868 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  24.2 
 
 		 866 aa  132  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.94 
 
 		 832 aa  132  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  22.91 
 
 		 834 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  22.79 
 
 		 833 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.94 
 
 		 846 aa  131  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  23.97 
 
 		 866 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  22.89 
 
 		 885 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.74 
 
 		 863 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  22.89 
 
 		 885 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.45 
 
 		 823 aa  126  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  24.74 
 
 		 854 aa  126  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  25.66 
 
 		 829 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  24.74 
 
 		 854 aa  126  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  25.81 
 
 		 829 aa  125  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  24.67 
 
 		 823 aa  124  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  24.67 
 
 		 823 aa  124  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  25.85 
 
 		 829 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  22.49 
 
 		 853 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.32 
 
 		 844 aa  124  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  25.66 
 
 		 829 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  25.66 
 
 		 829 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.86 
 
 		 871 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  24.49 
 
 		 829 aa  121  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.01 
 
 		 832 aa  121  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  22.26 
 
 		 853 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  22.35 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  22.42 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>