287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4146 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 846 aa  1735    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  53.14 
 
 		 881 aa  926    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  52.77 
 
 		 882 aa  920    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  53.55 
 
 		 881 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  51.65 
 
 		 885 aa  918    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  53.79 
 
 		 881 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  51.18 
 
 		 885 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  53.02 
 
 		 881 aa  928    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  46.2 
 
 		 826 aa  801    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  53.09 
 
 		 880 aa  929    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  52.97 
 
 		 880 aa  928    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  51.53 
 
 		 885 aa  917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  53.88 
 
 		 860 aa  923    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  67.46 
 
 		 844 aa  1189    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  53.55 
 
 		 881 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.08 
 
 		 826 aa  799    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.2 
 
 		 828 aa  824    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  53.67 
 
 		 881 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  51.53 
 
 		 885 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  56.12 
 
 		 835 aa  976    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.86 
 
 		 845 aa  696    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  46.32 
 
 		 826 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  53.14 
 
 		 881 aa  928    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  50.6 
 
 		 579 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  40.5 
 
 		 830 aa  602  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.32 
 
 		 832 aa  602  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  41.29 
 
 		 829 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  41.05 
 
 		 829 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  41.05 
 
 		 829 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  41.17 
 
 		 829 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  41.05 
 
 		 829 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.37 
 
 		 828 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.58 
 
 		 828 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.58 
 
 		 828 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.58 
 
 		 828 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.21 
 
 		 829 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.09 
 
 		 817 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.96 
 
 		 828 aa  558  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  38.16 
 
 		 833 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.39 
 
 		 832 aa  548  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  38.35 
 
 		 834 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  37.86 
 
 		 822 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  37.68 
 
 		 833 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  37.99 
 
 		 812 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.99 
 
 		 821 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  36.08 
 
 		 816 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  37.44 
 
 		 833 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  38.01 
 
 		 813 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.61 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.01 
 
 		 813 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  37.44 
 
 		 833 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  37.89 
 
 		 813 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  37.89 
 
 		 813 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  37.29 
 
 		 816 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.41 
 
 		 818 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  37.5 
 
 		 792 aa  512  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  32.36 
 
 		 820 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  29.62 
 
 		 856 aa  327  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  29.49 
 
 		 863 aa  326  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  29.13 
 
 		 878 aa  324  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  29.13 
 
 		 878 aa  324  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  29.24 
 
 		 878 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.01 
 
 		 878 aa  320  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  30.23 
 
 		 888 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  30.23 
 
 		 888 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  28.51 
 
 		 871 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  30.23 
 
 		 873 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  30.23 
 
 		 888 aa  308  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02222  hypothetical protein  58.46 
 
 		 298 aa  307  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.09 
 
 		 877 aa  304  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  29.99 
 
 		 888 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  30.06 
 
 		 866 aa  300  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.51 
 
 		 866 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.58 
 
 		 851 aa  299  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  29.36 
 
 		 866 aa  297  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  29.52 
 
 		 850 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  29.39 
 
 		 866 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.56 
 
 		 840 aa  296  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  29.39 
 
 		 866 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  29.36 
 
 		 866 aa  296  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.99 
 
 		 833 aa  295  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  29.35 
 
 		 833 aa  294  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.86 
 
 		 837 aa  293  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  28.64 
 
 		 833 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  29.99 
 
 		 840 aa  293  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  28.64 
 
 		 833 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.05 
 
 		 866 aa  292  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  29.27 
 
 		 866 aa  291  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  28.94 
 
 		 870 aa  291  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.87 
 
 		 876 aa  291  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  29.27 
 
 		 839 aa  290  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  28.47 
 
 		 870 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  29.76 
 
 		 851 aa  290  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  28.48 
 
 		 870 aa  290  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.1 
 
 		 851 aa  289  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  30.14 
 
 		 809 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  30.14 
 
 		 809 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  29.76 
 
 		 809 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  30.14 
 
 		 809 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  30.35 
 
 		 809 aa  288  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>