278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6324 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 
830 aa  1647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1679  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  76.49 
 
 
847 aa  1214    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 
830 aa  1647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2406  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.9 
 
 
812 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0491  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.35 
 
 
793 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4894  fimbrial usher protein  30.32 
 
 
802 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4928  fimbrial usher protein  29.95 
 
 
802 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4980  fimbrial usher protein  29.7 
 
 
802 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4479  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.44 
 
 
913 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.86 
 
 
783 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1631  putative fimbrial usher protein  29.09 
 
 
855 aa  257  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0163  fimbrial usher family protein  29.13 
 
 
789 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3870  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.8 
 
 
792 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3782  fimbrial usher protein  25.8 
 
 
792 aa  235  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0670  fimbrial usher protein  25.89 
 
 
792 aa  234  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0189299  normal  0.787892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.33 
 
 
844 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.14 
 
 
851 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  26.2 
 
 
837 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  25.87 
 
 
839 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.18 
 
 
853 aa  155  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.84 
 
 
852 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.48 
 
 
828 aa  151  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  26.58 
 
 
939 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  24.76 
 
 
850 aa  145  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  24.76 
 
 
833 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  26.45 
 
 
913 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  24.97 
 
 
833 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  26.45 
 
 
914 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  25.09 
 
 
833 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  26.45 
 
 
914 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.72 
 
 
875 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.72 
 
 
875 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.22 
 
 
866 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.65 
 
 
886 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.71 
 
 
884 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  24.91 
 
 
901 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.15 
 
 
963 aa  136  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  24.35 
 
 
839 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.99 
 
 
837 aa  134  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.78 
 
 
901 aa  134  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  24.04 
 
 
809 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  23.91 
 
 
809 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  23.91 
 
 
809 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  23.91 
 
 
809 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  23.7 
 
 
809 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  23.42 
 
 
863 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.89 
 
 
871 aa  129  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.02 
 
 
880 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.3 
 
 
838 aa  127  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.07 
 
 
837 aa  127  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.8 
 
 
859 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.2 
 
 
867 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  23.05 
 
 
838 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  23.05 
 
 
838 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  23.17 
 
 
838 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.72 
 
 
828 aa  125  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.3 
 
 
828 aa  125  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2388  fimbrial usher protein  23.33 
 
 
828 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.769414 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.05 
 
 
838 aa  124  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  23.05 
 
 
828 aa  124  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.06 
 
 
840 aa  124  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  24.85 
 
 
839 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  23.05 
 
 
838 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  23.47 
 
 
865 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2496  fimbrial usher protein  22.91 
 
 
828 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.775864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.77 
 
 
851 aa  122  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.96 
 
 
817 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.89 
 
 
857 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.61 
 
 
835 aa  121  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  25.37 
 
 
836 aa  121  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.66 
 
 
1040 aa  120  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.45 
 
 
851 aa  120  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.83 
 
 
829 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.26 
 
 
828 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.26 
 
 
828 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.82 
 
 
870 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.69 
 
 
861 aa  119  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  25.35 
 
 
836 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  23.82 
 
 
870 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.11 
 
 
850 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  25.11 
 
 
836 aa  118  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2295  fimbrial usher protein  22.5 
 
 
829 aa  118  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.79 
 
 
819 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.48 
 
 
828 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.334862 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  23.39 
 
 
822 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.45 
 
 
930 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2384  fimbrial usher protein  22.47 
 
 
829 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0771751  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  23.39 
 
 
812 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.34 
 
 
846 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  25.66 
 
 
836 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  22.08 
 
 
881 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.23 
 
 
831 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  22.06 
 
 
826 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  23.18 
 
 
842 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  21.96 
 
 
881 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  21.88 
 
 
866 aa  114  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.26 
 
 
821 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.63 
 
 
845 aa  114  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  21.77 
 
 
881 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  21.87 
 
 
881 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>