253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4894 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4894  fimbrial usher protein  100 
 
 
802 aa  1662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4980  fimbrial usher protein  99.25 
 
 
802 aa  1649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4928  fimbrial usher protein  99.25 
 
 
802 aa  1650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0491  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.03 
 
 
793 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.07 
 
 
830 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.07 
 
 
830 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2406  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.23 
 
 
812 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1679  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.63 
 
 
847 aa  357  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.44 
 
 
783 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4479  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.06 
 
 
913 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3870  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.73 
 
 
792 aa  277  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3782  fimbrial usher protein  27.73 
 
 
792 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0670  fimbrial usher protein  27.61 
 
 
792 aa  274  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0189299  normal  0.787892 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1631  putative fimbrial usher protein  27.63 
 
 
855 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0163  fimbrial usher family protein  27.63 
 
 
789 aa  225  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.79 
 
 
844 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.31 
 
 
866 aa  168  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  25.58 
 
 
868 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  25.37 
 
 
853 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  25.37 
 
 
853 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  25.26 
 
 
853 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.81 
 
 
838 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  26.78 
 
 
838 aa  154  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  26.78 
 
 
838 aa  154  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  25.26 
 
 
853 aa  154  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  25.14 
 
 
853 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  26.78 
 
 
838 aa  153  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  26.9 
 
 
863 aa  152  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  26.48 
 
 
838 aa  151  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.87 
 
 
838 aa  151  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  26.84 
 
 
939 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.43 
 
 
887 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.87 
 
 
837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.41 
 
 
850 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.37 
 
 
851 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  24.66 
 
 
872 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  25.92 
 
 
914 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  25.32 
 
 
854 aa  144  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.13 
 
 
863 aa  144  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  25.82 
 
 
913 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  25.32 
 
 
854 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  25.82 
 
 
914 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.34 
 
 
866 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.53 
 
 
929 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.82 
 
 
850 aa  141  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  23.92 
 
 
836 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  24.21 
 
 
836 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.85 
 
 
880 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.11 
 
 
851 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  24.34 
 
 
848 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  25.09 
 
 
865 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  24.34 
 
 
848 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.03 
 
 
828 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  24.11 
 
 
848 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  24.28 
 
 
836 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  24.54 
 
 
836 aa  134  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.91 
 
 
819 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  23.7 
 
 
814 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  23.81 
 
 
851 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.14 
 
 
857 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.4 
 
 
864 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.58 
 
 
930 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.67 
 
 
852 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.08 
 
 
832 aa  131  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.69 
 
 
823 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  23.76 
 
 
848 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  22.89 
 
 
842 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  24.92 
 
 
834 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.22 
 
 
886 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  23.11 
 
 
842 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  25.03 
 
 
839 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  23.68 
 
 
870 aa  129  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.46 
 
 
867 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.45 
 
 
859 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  22.89 
 
 
842 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  24.62 
 
 
833 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.62 
 
 
821 aa  127  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.49 
 
 
890 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.77 
 
 
856 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.52 
 
 
870 aa  127  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  23.39 
 
 
901 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  25 
 
 
812 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  25 
 
 
822 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  23.48 
 
 
823 aa  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  23.48 
 
 
823 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  24.32 
 
 
848 aa  125  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.17 
 
 
837 aa  125  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.23 
 
 
832 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.59 
 
 
852 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  25.06 
 
 
869 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  25.06 
 
 
869 aa  124  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  24.97 
 
 
869 aa  124  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.01 
 
 
876 aa  124  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.82 
 
 
845 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  25.06 
 
 
869 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  24.67 
 
 
869 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.15 
 
 
901 aa  122  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.79 
 
 
867 aa  122  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.97 
 
 
869 aa  122  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  23.44 
 
 
833 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>