255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4479 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4479  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 
913 aa  1841    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1679  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.15 
 
 
847 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.55 
 
 
830 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.55 
 
 
830 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2406  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.69 
 
 
812 aa  346  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.84 
 
 
783 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0491  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.43 
 
 
793 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4894  fimbrial usher protein  28.06 
 
 
802 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4980  fimbrial usher protein  27.6 
 
 
802 aa  300  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4928  fimbrial usher protein  27.83 
 
 
802 aa  299  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1631  putative fimbrial usher protein  25.15 
 
 
855 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0163  fimbrial usher family protein  25.15 
 
 
789 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0670  fimbrial usher protein  26.93 
 
 
792 aa  202  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0189299  normal  0.787892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3870  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.78 
 
 
792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3782  fimbrial usher protein  26.78 
 
 
792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.68 
 
 
850 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.52 
 
 
851 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.61 
 
 
844 aa  129  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.12 
 
 
880 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  25.03 
 
 
913 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  25.32 
 
 
939 aa  127  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  24.92 
 
 
914 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  25.03 
 
 
914 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.93 
 
 
866 aa  125  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.36 
 
 
840 aa  123  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  24.64 
 
 
836 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  25.06 
 
 
836 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.15 
 
 
832 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.56 
 
 
831 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.3 
 
 
837 aa  121  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1455  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.23 
 
 
841 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.93 
 
 
870 aa  120  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  23.39 
 
 
837 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  24.93 
 
 
870 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  25.68 
 
 
836 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.11 
 
 
852 aa  118  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.77 
 
 
837 aa  117  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  24.72 
 
 
836 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.4 
 
 
866 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.91 
 
 
857 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.1 
 
 
852 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.93 
 
 
828 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  22.53 
 
 
865 aa  111  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  24.91 
 
 
844 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.03 
 
 
887 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  25.13 
 
 
833 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.15 
 
 
823 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.28 
 
 
876 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  25.33 
 
 
833 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  25.33 
 
 
850 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  23.57 
 
 
829 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  21.51 
 
 
814 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  23.71 
 
 
829 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  25.07 
 
 
833 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.14 
 
 
963 aa  105  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  25.04 
 
 
823 aa  105  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  25.04 
 
 
823 aa  105  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.76 
 
 
872 aa  104  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  23.41 
 
 
869 aa  104  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  23.54 
 
 
869 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.73 
 
 
833 aa  103  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  23.29 
 
 
829 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.56 
 
 
861 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.04 
 
 
884 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  25.61 
 
 
839 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  23.41 
 
 
869 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.25 
 
 
867 aa  101  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  23.41 
 
 
869 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.51 
 
 
880 aa  101  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.41 
 
 
869 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.46 
 
 
829 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  23.43 
 
 
829 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.39 
 
 
930 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  23.83 
 
 
809 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  23.64 
 
 
809 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.25 
 
 
856 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  23.64 
 
 
809 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  23.64 
 
 
809 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  21.12 
 
 
842 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.37 
 
 
871 aa  99  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.67 
 
 
845 aa  98.6  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  23.49 
 
 
809 aa  99  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  22.29 
 
 
901 aa  98.6  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  23.18 
 
 
851 aa  98.2  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  23.42 
 
 
866 aa  98.2  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  22.94 
 
 
844 aa  98.2  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  23.29 
 
 
829 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.46 
 
 
817 aa  97.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  21.12 
 
 
842 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.8 
 
 
875 aa  96.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.25 
 
 
828 aa  97.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.17 
 
 
901 aa  96.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.66 
 
 
850 aa  96.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  21.26 
 
 
842 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.8 
 
 
875 aa  96.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  23.54 
 
 
842 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  23.15 
 
 
869 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.72 
 
 
851 aa  94.4  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.75 
 
 
867 aa  94.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.83 
 
 
853 aa  94  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>