More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3072 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 793 aa  1625    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  99.87 
 
 		 793 aa  1624    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  41.93 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  40.96 
 
 		 721 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  38.77 
 
 		 814 aa  542  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  41.08 
 
 		 714 aa  538  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  40.99 
 
 		 722 aa  534  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.53 
 
 		 755 aa  524  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  40.36 
 
 		 701 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  39.92 
 
 		 755 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.67 
 
 		 749 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.84 
 
 		 758 aa  515  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  40.43 
 
 		 762 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  39.69 
 
 		 708 aa  492  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.69 
 
 		 757 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.22 
 
 		 740 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  38.03 
 
 		 750 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  39.14 
 
 		 757 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  36.7 
 
 		 745 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.64 
 
 		 734 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.56 
 
 		 751 aa  442  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.38 
 
 		 737 aa  434  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.03 
 
 		 750 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  36.87 
 
 		 800 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  36.96 
 
 		 747 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 		 780 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.97 
 
 		 748 aa  425  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.61 
 
 		 738 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.88 
 
 		 760 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.83 
 
 		 777 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 		 790 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 		 813 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.34 
 
 		 741 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.22 
 
 		 737 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  36.3 
 
 		 749 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.11 
 
 		 758 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  35.3 
 
 		 685 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.4 
 
 		 742 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  35.64 
 
 		 874 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.45 
 
 		 809 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  33.2 
 
 		 721 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.68 
 
 		 757 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.29 
 
 		 711 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  32.23 
 
 		 716 aa  349  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  33.38 
 
 		 731 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.68 
 
 		 933 aa  346  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  33.56 
 
 		 731 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.58 
 
 		 756 aa  339  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.3 
 
 		 746 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  33.11 
 
 		 748 aa  330  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  33.2 
 
 		 731 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  33.2 
 
 		 922 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.63 
 
 		 1072 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  31.72 
 
 		 733 aa  320  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  31.72 
 
 		 733 aa  320  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  31.72 
 
 		 733 aa  320  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  31.99 
 
 		 733 aa  317  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  31.48 
 
 		 733 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  31.56 
 
 		 733 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  33.98 
 
 		 691 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  33.84 
 
 		 987 aa  310  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  32.17 
 
 		 748 aa  310  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  33.71 
 
 		 693 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  31.67 
 
 		 737 aa  304  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  29.18 
 
 		 829 aa  301  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.93 
 
 		 724 aa  298  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  32.69 
 
 		 748 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  32.87 
 
 		 779 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.85 
 
 		 1158 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  32.69 
 
 		 751 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  32.52 
 
 		 751 aa  294  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  32.52 
 
 		 751 aa  294  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.9 
 
 		 762 aa  293  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  31.17 
 
 		 730 aa  293  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  30.96 
 
 		 1338 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.1 
 
 		 1321 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  30.52 
 
 		 735 aa  284  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.6 
 
 		 772 aa  281  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  29.65 
 
 		 822 aa  281  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 		 805 aa  279  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  30.86 
 
 		 737 aa  278  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  30.09 
 
 		 731 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  28.23 
 
 		 819 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  30.39 
 
 		 778 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.24 
 
 		 778 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.33 
 
 		 777 aa  273  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.15 
 
 		 754 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  30.82 
 
 		 743 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  29.87 
 
 		 733 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  29.7 
 
 		 763 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.69 
 
 		 771 aa  270  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.87 
 
 		 814 aa  267  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  29.68 
 
 		 755 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.18 
 
 		 766 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  40.43 
 
 		 915 aa  266  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  30.47 
 
 		 931 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  29.68 
 
 		 755 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  30.86 
 
 		 765 aa  266  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  29.68 
 
 		 755 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  41.6 
 
 		 823 aa  266  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>