More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1288 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
274 aa  519  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  55.87 
 
 
255 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  53.16 
 
 
238 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  50.61 
 
 
238 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  50 
 
 
228 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  52.57 
 
 
261 aa  191  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  46.77 
 
 
241 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  51.22 
 
 
251 aa  175  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.89 
 
 
244 aa  175  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  46.26 
 
 
224 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.05 
 
 
234 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  51.94 
 
 
241 aa  168  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  46.26 
 
 
227 aa  168  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  49.56 
 
 
228 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  46.28 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  48.95 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  45.53 
 
 
230 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  44.4 
 
 
246 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  45.53 
 
 
230 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  45.53 
 
 
230 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  44.77 
 
 
252 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  43.98 
 
 
229 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  44.92 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  43.72 
 
 
239 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  50.63 
 
 
243 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  38.2 
 
 
276 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  43.6 
 
 
229 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  45.76 
 
 
250 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  41.9 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  37.11 
 
 
255 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  37.27 
 
 
264 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  40.24 
 
 
244 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  43.86 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  46.22 
 
 
231 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  34.59 
 
 
321 aa  135  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  31.86 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  38.52 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  44.05 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  39.13 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  38.87 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  39.04 
 
 
255 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  43.65 
 
 
252 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  40.43 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  43.25 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  41.32 
 
 
240 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  36.8 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  35.74 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  36 
 
 
264 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  38.43 
 
 
266 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  36.22 
 
 
266 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  40.77 
 
 
283 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  37.5 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  37.82 
 
 
259 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1078  protein of unknown function DUF152  38.93 
 
 
251 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  39.67 
 
 
254 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  37.02 
 
 
255 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  32.66 
 
 
271 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.26 
 
 
267 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  33.61 
 
 
224 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  41.43 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  30.2 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  36.05 
 
 
256 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  37.02 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  37.29 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  36.33 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  36.46 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  36.75 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  36.76 
 
 
267 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  33.95 
 
 
264 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  35.6 
 
 
265 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  28.46 
 
 
263 aa  115  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  36.95 
 
 
257 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.65 
 
 
263 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  34.3 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  37.4 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  36.05 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  34.8 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  34.51 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  39.23 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  36.25 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  36.76 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  36 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  36 
 
 
243 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  28.57 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  36 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  35.63 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  35.6 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  35.6 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  39.76 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.63 
 
 
243 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  37.13 
 
 
255 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  37.02 
 
 
252 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  37.3 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  31.72 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  35.2 
 
 
243 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  35.2 
 
 
243 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  33.2 
 
 
249 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  35.2 
 
 
263 aa  109  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  36.75 
 
 
246 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>