More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2902 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 406 aa  752    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  53.52 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  53.27 
 
 		 415 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  53.02 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  54.07 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  54.07 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  54.07 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  54.36 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1403  transporter, putative  62.76 
 
 		 148 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  32.47 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 433 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  24.29 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.21 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  24 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  30.67 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 461 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 416 aa  99.4  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 421 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 426 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 429 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 440 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 439 aa  86.3  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  30.22 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.34 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.04 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  29.41 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  30.58 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  30.51 
 
 		 535 aa  79.7  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  34.31 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  30.03 
 
 		 586 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  32.03 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  33.51 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  30.11 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>