63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2925 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  51.22 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  48.1 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  47.8 
 
 		 307 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  37.11 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  37.98 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  36.15 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  36.93 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  35.74 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  33.78 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  36.11 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  36.11 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  36.08 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  34.97 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  36.24 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  36.73 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  35.19 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  33.56 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  34.84 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  36.11 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  35.76 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  35.09 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  32.36 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  33.68 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  33.11 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  32.52 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  31.82 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  31.47 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  36.14 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  31.56 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  31.56 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  33.93 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  28.86 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  28.98 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  29.59 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  24.01 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  27.64 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  29.63 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  24.11 
 
 		 359 aa  89  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  27.35 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.78 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  25 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  25.51 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  25.51 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  25.51 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  25.51 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  25.51 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  22.34 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  21.32 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  23.15 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.41 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  22.51 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  21.52 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  25.77 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  21.52 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  20.91 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  24.11 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  24.55 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2926  hypothetical protein  26.42 
 
 		 213 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.657336  normal  0.332797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  30.99 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  31.94 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4252  hypothetical protein  34.29 
 
 		 177 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>