More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1324 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
375 aa  754    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 
375 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  34.34 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  34.62 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  34.34 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.34 
 
 
371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  34.07 
 
 
371 aa  212  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  34.34 
 
 
371 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  34.07 
 
 
371 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  34.07 
 
 
371 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  34.07 
 
 
371 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
374 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
371 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  36.73 
 
 
371 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
377 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
380 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  26.4 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  26.83 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.81 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.31 
 
 
363 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  30.08 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.26 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  30.13 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.25 
 
 
382 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.54 
 
 
371 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
375 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  28.3 
 
 
349 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
375 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
375 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.04 
 
 
375 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
375 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
366 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
375 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  28.61 
 
 
363 aa  99.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
363 aa  99.4  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
375 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  28.68 
 
 
361 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  29.02 
 
 
372 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.21 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.6 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
413 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.13 
 
 
371 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.73 
 
 
417 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  29.64 
 
 
376 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
366 aa  96.3  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  27.46 
 
 
684 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  29.64 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
441 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
365 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  28.8 
 
 
652 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  27.34 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  27.12 
 
 
404 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.39 
 
 
404 aa  89.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
367 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
381 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
425 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  26.46 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  26.2 
 
 
435 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  27.73 
 
 
330 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.93 
 
 
368 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  26.7 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.29 
 
 
365 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  27.73 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.66 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  28.99 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  28.99 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  29.85 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  25.59 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  28.99 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  29.85 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.88 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  29.85 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  34.2 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  30.22 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  25.79 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  25.23 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.1 
 
 
421 aa  82.8  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>