More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1213 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 367 aa  753    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  96.46 
 
 		 367 aa  738    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  66.76 
 
 		 364 aa  509  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  65.38 
 
 		 369 aa  497  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  57.69 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  56.3 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  56.39 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  63.47 
 
 		 331 aa  411  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  60.87 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  59.01 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  53.91 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  53.17 
 
 		 366 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  54.19 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  53.91 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  51.94 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  53.91 
 
 		 380 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  55.65 
 
 		 367 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  57.27 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  52.41 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  52.41 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  53.8 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  56.02 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  57.59 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  54.19 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  56.83 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  54.95 
 
 		 373 aa  388  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  56.97 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  54.89 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  57.28 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  52.25 
 
 		 375 aa  381  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.28 
 
 		 377 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  52.54 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  53.13 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  52.2 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 366 aa  371  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  49.86 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.05 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  55.69 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  57.41 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  55.25 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  54.05 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 369 aa  368  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  49.15 
 
 		 364 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  58.6 
 
 		 330 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  51.36 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  52.48 
 
 		 329 aa  363  4e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  52.44 
 
 		 356 aa  362  6e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  50.6 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  52.74 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.55 
 
 		 379 aa  359  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 364 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  47.88 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  53.23 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  51.37 
 
 		 367 aa  355  5.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  55.86 
 
 		 317 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  52.87 
 
 		 362 aa  355  1e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 		 326 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  47.43 
 
 		 365 aa  353  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  52.11 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  52.27 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  48.06 
 
 		 375 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  49.3 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  52.57 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  52.57 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  51.37 
 
 		 349 aa  353  4e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  52.57 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  54.43 
 
 		 312 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  52.27 
 
 		 365 aa  353  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 		 332 aa  352  5e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  49.86 
 
 		 365 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  50.76 
 
 		 349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  49.17 
 
 		 365 aa  352  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  50.46 
 
 		 372 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  52.27 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  51.18 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  51.36 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  47.89 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  52.24 
 
 		 331 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  51.66 
 
 		 382 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  51.67 
 
 		 354 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  49.02 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  56.15 
 
 		 310 aa  348  7e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 369 aa  348  9e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.29 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  50.74 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1904  peptide chain release factor 2  50.75 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.430397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  46.05 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 344 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  50.92 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  51.84 
 
 		 341 aa  346  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.89 
 
 		 371 aa  345  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  48.8 
 
 		 376 aa  345  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>