More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0598 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  510  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  51.41 
 
 
247 aa  247  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  48.18 
 
 
246 aa  242  5e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  46.56 
 
 
246 aa  237  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  46.64 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  48.22 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  46.46 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  47.04 
 
 
255 aa  229  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  44.88 
 
 
254 aa  229  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
259 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  42 
 
 
265 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.91 
 
 
257 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  45.28 
 
 
270 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  42 
 
 
297 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.97 
 
 
264 aa  205  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  43.87 
 
 
261 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
255 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
351 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  41.77 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  40.55 
 
 
262 aa  198  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  41.77 
 
 
261 aa  198  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  41.37 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  41.37 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
277 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  38.52 
 
 
263 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  40.96 
 
 
260 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  40.39 
 
 
260 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  40.55 
 
 
263 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
253 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  39.76 
 
 
272 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  39.37 
 
 
263 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40.56 
 
 
260 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
353 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  39.76 
 
 
273 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.73 
 
 
293 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  43.14 
 
 
255 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  39.53 
 
 
261 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
252 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  40 
 
 
260 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  38.01 
 
 
284 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40 
 
 
260 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
256 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40.32 
 
 
255 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  38.82 
 
 
254 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  37.75 
 
 
255 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  37.64 
 
 
288 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  37.75 
 
 
250 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  40.5 
 
 
327 aa  185  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  40.08 
 
 
258 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  40 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.6 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  38.34 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
315 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  41.94 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  40.8 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.56 
 
 
255 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  37.27 
 
 
284 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  40.24 
 
 
271 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  39.11 
 
 
252 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  38.19 
 
 
301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  38.8 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  46.18 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  36.95 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  37.5 
 
 
349 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  38.1 
 
 
259 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  38.55 
 
 
255 aa  181  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
256 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  40 
 
 
266 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  37.25 
 
 
268 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  40.24 
 
 
603 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  37.9 
 
 
367 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  38.55 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  36 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  40.32 
 
 
247 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
252 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  36.25 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  39.2 
 
 
252 aa  178  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  38.96 
 
 
280 aa  178  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  39.53 
 
 
274 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
247 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  40.56 
 
 
252 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  39.13 
 
 
265 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  36.95 
 
 
255 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  42.75 
 
 
608 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  40.56 
 
 
260 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  36.95 
 
 
259 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  40.96 
 
 
236 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  39 
 
 
278 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  38.8 
 
 
252 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  44.4 
 
 
242 aa  176  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  37.75 
 
 
255 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  37.85 
 
 
270 aa  175  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
254 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  38.43 
 
 
268 aa  174  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  39.11 
 
 
258 aa  174  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>